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能源材料计算软件之微观、介观:LAMMPS

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发布时间2024-03-25

        LAMMPS是一款经典的分子动力学代码,着重于材料建模,可以模拟液体中的粒子、固体和气体的系综。它对于固态材料(如金属、半导体)和软物质(如生物分子、聚合物)以及粗粒或介观系统具有强大的模拟能力。

        LAMMPS是一个可以修改和扩展的计算程序,它的许多型号都具有可在CPU、GPU和Intel Xeon Phis上提供加速性能的版本。代码旨在易于修改或扩展新功能,因此用户可以根据具体需求进行定制。此外,LAMMPS是根据GPL条款作为开放源代码分发的,所有版本都可以在GitHub上访问,定期发布的内容也会发布到SourceForge,这为科研工作者提供了便利。

         在并行计算方面,LAMMPS支持串行和并行计算,通过采用分布式MPI策略和模拟空间的分解并行机制来提高计算效率。在并行机上,LAMMPS采用的是空间分解技术来分配模拟的区域,把整个模拟空间分成较小的三维小空间,其中每一个小空间可以分配在一个处理器上。各个处理器之间相互通信并且存储每一个小空间边界上的“ghost”原子的信息。

         在建模方面,LAMMPS主要用于原子建模,或者更一般地,可以用作原子、中观或连续尺度的并行粒子模拟器。然而,对于复杂的模型,LAMMPS可能需要与其他专业软件(如atomsk)进行辅助建模。此外,对于LAMMPS模拟结果的分析,可以借助一些后处理工具,如vmd,这些工具可以方便地分析LAMMPS的轨迹,如进行氢键的分析等。

         LAMMPS是一个强大且灵活的分子动力学工具,适用于各种尺度的材料建模和模拟,为科研工作者提供了广泛的研究可能性。以下Lammps教程及视频,赶紧学习起来吧!

         视频教程:Lammps视频教程、分子动力学模拟:https://www.bilibili.com/video/BV1Af4y1z7vu/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click&vd_source=b2b8e05a4906b3ebeb5034f8154332bf

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